Kapsaisin beyne gönderilen ağrı sinyallerinin sayısını azalttığı için ağrıyı hafifletmeyle de bağlantılıdır. Ülsere neden olan bakterilerin büyümesini kısıtladığı için ülserden kaynaklanan iç ağrılar için özellikle faydalıdır.