Arı sütü genellikle güvenli kabul edilse de astım, anafilaksi, kontakt dermatit gibi ciddi yan etkiler bildirilmiştir. Polen veya diğer çevresel alerjenlere alerjisi olan kişiler dikkatli olmalıdır. Pestisitler gibi bazı çevresel kirleticiler de arı sütünde bulunur ve alerjik reaksiyonlara yol açabilir.