Soğanları saklarken, arada bir onları kontrol etmek de önemlidir. Soğanların arasında çürüyen veya filizlenen bir soğan varsa, aralarından çekmelisiniz. Ara sıra soğanları kontrol edip, çürüyenleri ayırarak kalan soğanların daha uzun süre taze kalmasını sağlayabilirsiniz.
Kırmızı, beyaz ve sarı soğan gibi farklı türdeki soğanları ayrı ayrı saklamak daha iyidir. Her soğan türü, farklı hızda çürüme ve filizlenme özelliğine sahip olabilir. Her bir soğan türünü ayrı kaplarda veya torbalarda saklanmalı.