Yoğurdun sindirimi sütten daha kolaydır. Protein alerjisi veya laktoz hassasiyeti olanlar sütten uzak dursa da yoğurt yiyebilir. Yoğurt bağırsaklar için çok faydalıdır. Bağırsaklarda yaşayan bakterilerin sağlıklı bir şekilde yaşam sürmesini sağlar. Diğer besin maddelerinin de emilimine destek olur. İçerisindeki laktik asit sütteki kalsiyumun sindirimini kolaylaştırır. Bağışıklık sistemini destekleyen yoğurdun anti-tümör etkileri olduğu da bazı araştırmalar tarafından ortaya çıkarılmıştır. Bazı viral ve bakteriyel rahatsızlıklar bağırsakların yapısını bozabilir. Yoğurt bu hasarın giderilmesinde büyük rol oynar.