2000-2004 yılları arasında Türkiye millî futbol takımını yöneten Güneş, 2002 yılında Türkiye'yi 1954'ten sonra ilk kez FIFA Dünya Kupası'na götürdü. 2002 FIFA Dünya Kupası'nde bronz madalya kazandırdı. 2003 Konfederasyonlar Kupası'nda da aynı başarıyı tekrarladı.
Başarılı teknik adam, 2022 yılı Ekim ayında Beşiktaş ile yeniden anlaştı.
Türkiye-Teknik Direktör|| Görev Süresi:18 Mar 2019-10 Eyl 2021 || 32 Maç
Beşiktaş JK-Teknik Direktör|| Görev Süresi:12 Haz 2015-1 May 2019 || 198 Maç
Bursaspor-Teknik Direktör|| Görev Süresi:10 Haz 2014-4 Haz 2015 || 49 Maç
Trabzonspor-Teknik Direktör|| Görev Süresi:4 Ara 2009-29 Oca 2013 || 145 Maç
FC Seoul-Teknik Direktör|| Görev Süresi:8 Oca 2007-25 Kas 2009 || 125 Maç
Trabzonspor-Teknik Direktör|| Görev Süresi:17 Oca 2005-26 Eyl 2005 || 29 Maç
Türkiye-Teknik Direktör|| Görev Süresi:1 Tem 2000-6 Mar 2004 || 50 Maç
Sakaryaspor-Teknik Direktör|| Görev Süresi:1 Eyl 1998-8 Şub 1999 || 17 Maç
Antalyaspor-Teknik Direktör|| Görev Süresi:28 Tem 1997-30 Haz 1998 || 35 Maç
Trabzonspor-Teknik Direktör|| Görev Süresi:23 Eyl 1993-3 Şub 1997 || 150 Maç
Trabzonspor-Yardımcı antrenör|| Görev Süresi:9 Tem 1993-23 Eyl || 1993
İstanbulspor-Teknik Direktör|| Görev Süresi:17 Eki 1992-30 Haz 1993
Boluspor-Teknik Direktör|| Görev Süresi:19 Eki 1989-30 Haz 1992 || 86 Maç
Trabzonspor-Teknik Direktör|| Görev Süresi:13 Eyl 1988-17 Ağu 1989 || 36 Maç
Trabzonspor-Yardımcı antrenör|| Görev Süresi:27 Oca 1988-13 Eyl 1988
