Peyniri saklarken kullanılan kaplar da büyük önem taşır. Plastik kaplar yerine hava alabilen cam kaplar tercih edilmelidir. Cam saklama kaplarının içine bir adet yağlı kağıda sarılı şeker koyarak peynirin nemden korunmasını sağlayabilirsiniz. Ayrıca peynirin kuru bir bez ya da kağıt havluya sarılması da fazla nemin emilmesine yardımcı olur.
Eğer peynirinizi uzun süre saklamak istiyorsanız dondurucuya koyabilirsiniz. Beyaz peynir, kaşar ve lor gibi peynirler dondurulabilir ve çözüldüğünde lezzetinden çok fazla kayıp yaşamaz. Ancak peynir dondurulmadan önce hava geçirmez bir poşet ya da streç film ile sarılmalı, porsiyonlara ayrılarak saklanmalıdır.