Oyuncu Burak Özçivit ile yaşadığı birliktelikle bir dönem adından sıkça söz ettiren Özer, evlilik planları yaptığı konuşulurken, 2011'de sürpriz bir kararla ilişkisini bitirmişti.
Levent İyigel ile nikah masasına oturduktan sonra Ali adını verdiği oğlunu kucağına alan Başak Özer, uzun yıllardır gözlerden uzak bir yaşam sürüyor.
Özer, eşi Levent İyigel ile yer aldığı kareye, kalp emojisiyle birlikte, "İyi ki doğdun hayat arkadaşım. Nice yıllarımız olsun. Seni çok çok çok seviyorum, seviyoruz" notunu yazmıştı.